آیت الله شبیری زنجانی بعد از شهادت رهبر انقلاب در پیامی نوشت: خبر انتخاب حضرت آیت‌الله امام سید مجتبی حسینی خامنه‌ای از سوی خبرگان محترم رهبری، مرا تا حدی تسکین داد.

بخشی از پیام آیت‌الله شبیری زنجانی بعد از شهادت رهبرانقلاب بعد از درگذشت ایشان بازنشر شده است. در متن این پیام آمده است:

هرگز تصور نمی‌کردم روزی را درک کنم و شاهد شهادت مظلومانه و مقتدرانه رفیق دیرینم، سیدعلی باشم، عزیز و دوست هشتادساله‌ای که همچون امیر المومنین (ع) و حسین بن علی (ع) درماه مبارک رمضان به همراه فرزند و کودکانش به دست شقی‌ترین دشمنان، یعنی صهیونیست‌های جنایتکار، به فیض عظمای شهادت نائل آمد. شهادتی که در میان علمای اسلام کم‌نظیر است و این اندوه جانکاه، جز با نابودی کامل اسرائیل و تحقق رجعت آن سید حکیم در پرتو ظهور حضرتت، التیام نمی‌یابد.

این جانب در حالی که در حرم ملکوتی امام رضا(ع) داغدار بودم، خبر انتخاب حضرت آیت‌الله امام سید مجتبی حسینی خامنه‌ای از سوی خبرگان محترم رهبری، مرا تا حدی تسکین داد.